| 專業代碼 | 專業名稱 | 所屬門類 | 所屬一級學科 | 專業類型 | 開設院校 |
| 100102 | 免疫學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共87所 |
| 100101 | 人體解剖與組織胚胎學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共84所 |
| 100104 | 病理學與病理生理學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共84所 |
| 100103 | 病原生物學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共81所 |
| 100105 | 法醫學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共41所 |
| 100100 | 基礎醫學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共36所 |
| 100106 | 放射醫學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共27所 |
| 1001Z1 | 分子醫學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共10所 |
| 1001J1 | 疼痛醫學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共8所 |
| 1001Z2 | 醫學信息學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共8所 |
| 1001Z1 | 醫學生物化學與分子生物學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共5所 |
| 1001Z2 | 醫學生物化學與分子生物學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共5所 |
| 1001Z3 | 醫學生理學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共4所 |
| 1001Z4 | 醫學細胞生物學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共3所 |
| 1001J1 | 人文醫學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共3所 |
| 1001J4 | 醫學心理學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共3所 |
| 1001Z1 | 醫學神經生物學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共3所 |
| 1001Z5 | 病理學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共3所 |
| 100120 | 病理學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共2所 |
| 100123 | 醫學生物化學與分子生物學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共2所 |
| 100125 | 醫學細胞生物學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共2所 |
| 100122 | 人體生理學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共2所 |
| 1001Z2 | 醫學生理學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共2所 |
| 1001Z8 | 醫學生物信息學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共2所 |
| 1001Z3 | 醫學系統生物學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共2所 |
| 1001Z1 | 干細胞與再生醫學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共2所 |
| 100120 | 生殖醫學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共2所 |
| 100121 | 病理生理學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共2所 |
| 100124 | 醫學神經生物學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共2所 |
| 1001J3 | 醫學分子生物學 | 醫學 | 基礎醫學 | 專業碩士 | 共2所 |